Dentro do Programa Operativo de Galicia 2007-2013 a Confederación Hidrográfica del Miño-Sil ten outorgadas axudas do FEDER para actuacións do eixo 3 (Medio ambiente, contorna natural, recursos hídricos e prevención de riscos) nas categorías de gasto 46 [Tratamento da auga (auga residual)] e 51 [Fomento da protección da biodiversidade e a natureza (incluído o programa Natura 2000)] e 53 [Prevención de riscos (incluídas a elaboración e aplicación de plans e medidas para previr e xestionar os riscos naturais e tecnolóxicos)]. As actuacións cofinanciadas por este Fondo e que están executadas son as seguintes:

• Proxecto do colector de saneamento no peirao Fernández Ladreda da Malata. (Ferrol)
• Emisario Submarino de Cabo Prioriño. Depuración e vertedura de Ferrol (A Coruña)
• Mellora do saneamento e EDAR de San Cibrao das Viñas (Ourense)
• Mellora do saneamento de Pereiro de Aguiar (Ourense)
• Ampliación da EDAR do O Barco de Valdeorras (Ourense)
• Mellora da capacidade de eliminación de nutrientes da EDAR de Xinzo de Limia (Ouresnse)
• Proxecto de actuacións prioritarias no saneamento do Porriño (Pontevedra)
• Nova EDAR de Pontebarxas, T.M. de Padrenda (Ourense)
• Adecuación da canle e ordenación de marxes dos ríos Sarria e Celeiro no T.M. de Sarria (1ª Fase)
• Acondicionamento da canle e marxes do río Cabe ao seu paso por Monforte de Lemos (Lugo). Tramo: A Compañia - Núcleo de Piñeira
• Mellora ambiental das marxes do arroyo do polígono industrial de San Cibrao das Viñas (Ourense)
• Acondicionamento, accesos e uso público das fervenzas de Tourón, no río Cerves. TM de Melón
• Restauración ambiental e mellora da drenaxe no río Canedo, T.M. de Ponteareas (Pontevedra)
• Acondicionamento da canle e marxes do río Badella ao seu paso por Bande (Ourense)
• Mellora da calidade das augas e recuperación ambiental do ámbito do embalse Das Conchas. TT.MM. de Bande y Muiños (Ourense)
• Protección das marxes contra a erosión no río Louro. T.M. de O Porriño (Pontevedra)
• Acondicionamento de marxes no regueiro Aboal. T.M. de Mondaríz (Pontevedra)
• Ordenación da canle e marxes do río Louro ao seu paso por Mos (Pontevedra)
• Actuacións de mellora do dominio público hidráulico e a capacidade de desaguadoiro do río Limia no tramo urbano de Xinzo de Limia (Ourense)
• Actuacións de restauración hidrolóxico-forestal en varios tramos fluviais da Comunidade Autónoma de Galicia
• Proxecto de acondicionamento e ampliación da senda peonil da marxe dereita do río Miño entre o encoro de Velle e Os Peares (Ourense)
• Colector interceptor do río Sar. Tramo: Pontepedriña-EDAR de Silvouta. Saneamento de Santiago de Compostela (A Coruña). (Fondos da Dirección Xeral da Auga)
• Acondicionamento dos colectores xenerais e interceptores da marxe dereita do río Miño en Ourense. Tramo: Ponte Nova-Balneario. Mellora do saneamento de Ourense. (Fondos da Dirección Xeral da Auga)