Dentro del Programa Operativo de Galicia 2007-2013 la Confederación Hidrográfica del Miño-Sil tiene otorgadas ayudas del FEDER para actuaciones del eje 3 (Medio ambiente, entorno natural, recursos hídricos y prevención de riesgos) en las categorías de gasto 46 [Tratamiento del agua (agua residual)], 51 [Fomento de la protección de la biodiversidad y la naturaleza (incluido el programa Natura 2000)] y 53 [Prevención de riesgos (incluidas la elaboración y aplicación de planes y medidas para prevenir y gestionar los riesgos naturales y tecnológicos)]. Las actuaciones cofinanciadas por este Fondo y que están ejecutadas son las siguientes: